Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp10O55123 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp10O55123 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms