Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms