Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb2O55029 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb2O55029 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb2O55029 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb2O55029 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms