Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SlkO54988 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SlkO54988 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SlkO54988 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SlkO54988 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SlkO54988 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SlkO54988 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SlkO54988 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SlkO54988 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SlkO54988 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SlkO54988 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SlkO54988 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SlkO54988 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SlkO54988 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SlkO54988 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SlkO54988 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SlkO54988 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SlkO54988 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SlkO54988 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SlkO54988 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SlkO54988 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SlkO54988 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SlkO54988 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SlkO54988 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SlkO54988 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SlkO54988 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SlkO54988 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SlkO54988 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SlkO54988 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SlkO54988 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SlkO54988 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SlkO54988 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SlkO54988 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SlkO54988 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SlkO54988 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SlkO54988 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SlkO54988 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SlkO54988 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SlkO54988 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SlkO54988 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SlkO54988 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SlkO54988 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SlkO54988 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SlkO54988 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SlkO54988 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SlkO54988 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SlkO54988 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms