Protein–RNA interactions for Protein: O54926

Siva1, Apoptosis regulatory protein Siva, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siva1O54926 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siva1O54926 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Siva1O54926 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms