Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1i2O54915 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1i2O54915 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms