Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbieO54910 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbieO54910 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms