Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itgb3O54890 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb3O54890 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms