Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Srpk2O54781 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Srpk2O54781 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms