Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms