Protein–RNA interactions for Protein: O35984

Pbx2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx2O35984 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbx2O35984 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbx2O35984 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms