Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag2O35638 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag2O35638 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag2O35638 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag2O35638 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag2O35638 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stag2O35638 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag2O35638 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stag2O35638 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stag2O35638 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms