Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Notch2O35516 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Notch2O35516 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch2O35516 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch2O35516 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch2O35516 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms