Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk3O35492 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk3O35492 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk3O35492 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk3O35492 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clk3O35492 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clk3O35492 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clk3O35492 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms