Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edil3O35474 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Edil3O35474 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Edil3O35474 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edil3O35474 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edil3O35474 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Edil3O35474 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edil3O35474 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms