Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Kpna3O35344 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna3O35344 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms