Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfrsf11aO35305 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf11aO35305 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.5 ms