Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms