Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pkd2O35245 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pkd2O35245 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms