Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms