Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad6O35182 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad6O35182 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad6O35182 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad6O35182 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms