Protein–RNA interactions for Protein: O35084

Cyp27b1, 25-hydroxyvitamin D-1 alpha hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27b1O35084 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp27b1O35084 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp27b1O35084 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp27b1O35084 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp27b1O35084 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp27b1O35084 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp27b1O35084 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp27b1O35084 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms