Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nfil3O08750 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms