Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp12O08736 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp12O08736 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp12O08736 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp12O08736 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp12O08736 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp12O08736 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp12O08736 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp12O08736 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp12O08736 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp12O08736 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms