Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
U90926O08546 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
U90926O08546 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
U90926O08546 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
U90926O08546 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
U90926O08546 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
U90926O08546 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
U90926O08546 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
U90926O08546 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
U90926O08546 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
U90926O08546 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
U90926O08546 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
U90926O08546 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
U90926O08546 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
U90926O08546 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
U90926O08546 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
U90926O08546 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
U90926O08546 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms