Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsmbO08540 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsmbO08540 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsmbO08540 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsmbO08540 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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