Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn2O08529 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn2O08529 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn2O08529 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn2O08529 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn2O08529 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn2O08529 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms