Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl4M0QW46 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms