Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21310J3QQ23 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21310J3QQ23 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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