Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21972J3QN38 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms