Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3415J3QMS8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3415J3QMS8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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