Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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