Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms