Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20696H3BJN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms