Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r67G5E8C1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms