Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms