Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfgef1G3X9K3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 442.4 ms