Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna9G3X8Z7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms