Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20509G3UZF1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20509G3UZF1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20509G3UZF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20509G3UZF1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20509G3UZF1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20509G3UZF1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20509G3UZF1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20509G3UZF1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20509G3UZF1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms