Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx1-1G3UXB3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-1G3UXB3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms