Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms