Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NpcdF8VQB8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms