Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Farp1F8VPU2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Farp1F8VPU2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Farp1F8VPU2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Farp1F8VPU2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Farp1F8VPU2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Farp1F8VPU2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Farp1F8VPU2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Farp1F8VPU2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Farp1F8VPU2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.4 ms