Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LctF8VPT3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LctF8VPT3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LctF8VPT3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LctF8VPT3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LctF8VPT3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms