Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms