Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17654F7AXR3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms