Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms