Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8005F6YKY3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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