Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8220F6YKI2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8220F6YKI2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8220F6YKI2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8220F6YKI2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8220F6YKI2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8220F6YKI2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8220F6YKI2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8220F6YKI2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8220F6YKI2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8220F6YKI2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms