Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21970F6XX07 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms