Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8247F6VRJ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.6 ms